L’Assemblea Consortile esercita le funzioni di indirizzo strategico e di controllo nei confronti degli organi consortili, anche ai fini del controllo analogo congiunto. E' composta dai Rettori delle Università statali consorziate, o loro delegati da due rappresentanti dei Ministeri, dai Presidenti degli Enti di ricerca consorziati o loro delegati, dai rappresentanti legali delle altre persone giuridiche pubbliche consorziate. Il Presidente dell'Assemblea Consortile è il Presidente di Cineca, Francesco UBERTINI, professore ordinario dell'Alma Mater Studiorum Università di Bologna